Science子刊：新一代高通量测序可预测早期癌症是否会转移

一种基因测序活检方法可以准确预测哪些早期阶段的皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL）患者将会发展成严重转移肿瘤。 

蕈样肉芽肿（mycosis fungoides，MF）是一种原发于皮肤的T淋巴细胞恶性肿瘤，这种癌症起始于皮肤而不是淋巴结，其第一个征兆通常是皮疹。大多数患有这种疾病的患者最常见的类型是皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL），其疾病发展缓慢，并且通常还是有正常的预期寿命。

但是，一小部分患者会发展成一种侵袭性的，致命的疾病形式，可以传播到整个皮肤及其他部位，因而无法治愈。如果能早期发现，具有这种侵袭性MF形式的患者可以接受干细胞移植治疗该疾病，但如果MF已经发展变为耐药性质的了，那就几乎不可能通过干细胞移植得到完全缓解。

因此需要一种能准确确定哪些早期阶段患者会发生癌症转移的技术。

来自布莱根妇女医院的研究人员发现，针对一种特定基因：T细胞受体β（TCRB）的新一代高通量测序可以作为更有力的预测指标，预测早期患者是否具有癌症转移的风险。

这一研究成果公布在Science Translational Medicine杂志上。

文章资深作者，皮肤病学系主任Thomas Kupper博士说，“我们很高兴为MF患者提供精准的药物。虽然这项研究还需要进一步深入的研究工作，但我们认为这种方法可以前瞻性地确定会发展成侵袭性肿瘤，危及生命的患者亚群，从而能更早的进行治疗，治愈他们的癌症。”

超过80％的早期MF患者其实并不会有疾病进展，但即使采用目前的疗法，MF患者晚期的预后不佳，预期寿命从一年半到四年不等。

Kupper及其同事于1999年在Dana-Farber癌症研究所成立了皮肤淋巴瘤诊所，其目标之一是为MF和其他形式的CTCL开发更好的诊断和预后工具。自2002年以来，近900名患者参加了他们的纵向研究，通过活检和血液样本追踪其疾病进展。

在目前的研究中，研究人员从300多名早期CTCL患者的病灶部位收集了皮肤组织，进行了T细胞受体基因测序，这些患者大多患有MF。研究人员采用高通量DNA测序技术，一次测序大量DNA，从大量病灶部位细胞中获取TCRB基因数据。然后他们用其检测“肿瘤克隆频率（TCF）” ，也就是突变MF淋巴瘤T细胞克隆的T细胞百分比。TCF升高，就表明MF患者疾病发展的可能性升高。

“在显微镜下，良性T细胞和MF T细胞很难区分，”Kupper说，“但每个T细胞都有一个独特的T细胞受体DNA序列，我们可以通过高通量DNA测序来检测，高通量DNA测序和TCF计算使我们能够进行前所未有的预测。作为从事这一疾病多年研究的医生，我很高兴能够给这些患者带来新的希望。”

原文标题：

High-throughput sequencing of the T cell receptor β gene identifies aggressive early-stage mycosis fungoides